evolution, sci

Быстрые радиации: опыт исследований полевок и леммингов

На первом весеннем семинаре — приглашённый доклад коллег-зоологов из ЗИНа

3 марта (вторник), 17:30, аудитория 140 (3058)

Лаборатория молекулярной систематики ЗИН РАН

Наталья Иосифовна Абрамсон, к.б.н., зав. лаб.
Ольга Васильевна Бондарева, аспирант
Евгений Александрович Генельт-Яновский, к.б.н, н.с.

Быстрые радиации: распутывание сложных филогенетических клубков и поиск следов отбора в геноме. Пример исследований полевок и леммингов.

Вместе с развитием методов высокопроизводительного секвенирования (next generation sequencing, NGS) у исследователей  появилась возможность коренным образом поменять прежний подход, основанный на данных анализа отдельных, немногочисленных локусов и протестировать многие, противоречивые с точки зрения морфологических данных, молекулярные филогении и эволюционные сценарии. Исследования, основанные на полногеномных и транскриптомных данных, позволяют подойти к анализу молекулярных основ формирования адаптаций на различной эволюционной шкале, сравнивая крупные таксоны и таксоны видового уровня (макротаксономический и микротаксономический уровень). Хорошую возможность выяснить механизмы, способствующие видообразованию и дивергенции, дает исследование групп, которые претерпели быстрые радиации в недавнем прошлом. Однако реконструкция филогенетических связей в таких группах с быстрой радиацией представляет собой труднейшую задачу, практически неразрешимую при применении небольшого количества молекулярных маркеров. В то же время надежная реконструкция филогении — необходимое условие и контекст для любого рода эволюционных исследований. Поскольку процессы быстрой радиации повторяются в разных узлах эволюционного дерева, то у исследователей постоянно возникают и огромные трудности с выявлением филогенетических взаимоотношений в этих узлах, так называемых “жестких политомий”.

С развитием высокопроизводительного секвенирования, когда в анализ включаются одновременно тысячи маркеров, возможность разрешения таких политомий и уточнения филогенетических схем становится выполнимой задачей.

Модельная группа, о которой пойдет речь в наших сообщениях — подсемейство полевочьих (Arvicolinae) — очень хороший объект для исследования перечисленных вопросов по целому ряду причин. Это одна из самых молодых, быстро эволюционирующих и многочисленных групп в подотряде мышеобразных грызунов, распространенных во всех ландшафтах умеренной и арктической зон северного полушария. Она великолепно представлена в палеонтологической летописи, что делает возможным калибровку молекулярных деревьев и расчет времен дивергенций и скорости мутаций. Эта группа представляет собой одну из самых быстрых документированных радиаций среди современных млекопитающих и в течении ее эволюционного развития наблюдается, по крайней мере, еще два-три таких “взрывных” этапа быстрой дивергенции (Абрамсон и др., 2009). До настоящего времени, несмотря на ее интенсивное изучение, в том числе и с применением молекулярных методов, неизвестными остаются филогенетические связи в подсемействе на разных уровнях дивергенции. Полевочьи освоили самые разнообразные экологические ниши, а сходные адаптации, в частности, к жизни под землей или высокогорьях, возникали неоднократно в различных филогенетических линиях.

Во время доклада мы представим предварительные результаты анализа филогении полёвочьих с использованием данных секвенирования полных митохондриальных геномов и поиска следов отбора в белок-кодирующих митохондриальных генах.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

department, protista

Солнечный семинар

После удлинённых выходных ждём вас на семинаре — выступит сотрудник нашей кафедры

25 февраля (вторник), 17:30, аудитория 140 (3058)

Василий Златогурский, к.б.н.
Центрохелидные солнечники: что мы узнали о них за последние 10 лет?

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

department, phd, phd3, protista, White Sea

Начало семинаров в весеннем семестре

Семинар кафеды возвращается к регулярной работе — как всегда, по вторникам в 17:30. На семестр намечена плотная программа, за планами и их изменениями можно следить на https://zooseminar.wordpress.com/current-longterm-program/

18 февраля (вторник), 17:30, аудитория 140 (3058)

Татьяна Миролюбова (аспирант 3-го года)
Грегариноподобный организм Digyalum oweni (Alveolata): филогенетическое положение и морфо-биологические особенности.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

Crustacea, metazoa

Копеподы — самые многочисленные многоклеточные

Неожиданные и увлекательные планы кафедрального семинара на «межсезонье» — доклад о современных направлениях, сложностях и значении исследований копепод. Автор — один из крупнейших специалистов по этой группе; успевайте послушать, не каждый день в Питере!

24 января(пятница), 16:00, аудитория 140 (3058)

Copepods – an introduction to the most abundant metazoan clade of the Tree of Life

Prof. Rony J. Huys (Natural History Museum, London)

No group of plants or animals on Earth exhibits the range of morphological diversity as seen among the extant Crustacea. This structural disparity is best demonstrated by the Copepoda, which by virtue of their immense vertical distribution – from the nutrient-rich black oozes of abyssal ocean depths to the nutrient-poor waters of the high Himalayas, spanning three quarters of the possible global vertical range – outnumber every other multicellular animal group on Earth, including the hyper-abundant insects and nematode worms. These small crustaceans are found throughout the world’s natural and man-made aquatic environments, spanning the entire salinity range from freshwater to hypersaline. They underpin the world’s freshwater and marine ecosystems, are sensitive bio-indicators of local and global climate change, key ecosystem service providers, and parasites of economically important aquatic animals. Copepods sustain the majority of world fisheries and through their roles as vectors of disease, also have a number of direct and indirect effects on human health and quality of life.

With nearly 14,000 valid species, and outnumbering the insects by up to three orders of magnitude, copepods carry a global biological importance that is belied by their generally small size. In the pelagic realm, representing a volume of 1,347 million km3 and being the largest biome on the planet, copepods are the dominant members of the zooplankton, both numerically and in terms of biomass. They are also the most species-rich group of the zooplankton, with approximately 2,100 described species in the pelagic environment and the dominant group within most marine sediments, second in abundance only to nematodes. In addition to life-strategies that encompass free-living, substrate-associated and interstitial habits, copepods also have extensive impacts in their role as associates or parasites of the majority of aquatic metazoan phyla, from sponges to chordates, including reptiles and marine mammals. This variety of life strategies has generated an incredible morphological plasticity and disparity in body form and shape which are arguably unrivalled among the Crustacea. My aims in this talk are to provide an informative introduction to copepods, to illustrate some research highlights, and to reflect on the importance and the potential difficulties of working on the most abundant multicellular component of the planet’s biota

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

department, Digenea, metazoa, phd, White Sea

Последний семинар года

25 декабря (среду), 17:00, аудитория 140 (3058)

Анна Гончар (предзащита кандидатской диссертации)
Жизненные циклы трематод сем. Notocotylidae в экосистемах прибрежья северных морей.
Научный руководитель К.В. Галактионов

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

Bryozoa, Cnidaria, department, Digenea, evolution, metazoa, Mollusca, phd, phd2, phd3, sci

Неделя семинаров :Р

На следующей неделе каждый вечер на кафедре в аудитории 140 (3058) будут научные мероприятия. Обратите внимание, что начало в 17:00, кроме вторника (17:30). Если коротко:

  • 16, 18 и 20 декабря в 17:00 — лекции Григория Гениховича (Университет Вены) по эволюционной биологии развития. Совместное мероприятие с Биосеминарами, подробнее о миникурсе можно узнать здесь.
  • 17 декабря в 17:30 — доклады аспирантов на семинаре кафедры
  • 19 декабря в 17:00 — предзащита кандидатской диссертации Арсения Лобова

И чуть подробнее, по дням:

16 декабря (понедельник), 17:00 (~3 часа)
Григорий Генихович. Эволюционная биология развития. Лекция 1. Молекулярные механизмы возникновения различий .

17 декабря (вторник), 17:30
— Елена Беликова (3 год). Эволюция мышечной системы морских мшанок (Stenolaemata и Gymnolaemata). Научный руководитель А.Н. Островский.
— Пётр Смирнов (1 год). «Пассивные» мирацидии. Морфология и метаморфоз миниатюризированных личинок. Научный руководитель К.В. Галактионов.

18 декабря (среда), 17:00 (~3 часа)
Григорий Генихович. Эволюционная биология развития. Лекция 2. Механизмы формирования паттерна.

19 декабря (четверг), 17:00
Арсений Лобов. Анализ белков взаимодействия гамет в системе криптических видов моллюсков рода Littorina. Предзащита кандидатской диссертации. Научный руководитель А.Л. Мальцева.

20 декабря (пятница), 17:00 (~3 часа)
Григорий Генихович. Эволюционная биология развития. Лекция 3. 3.1. Проблема гомологии и аналогии. 3.2. Как сделать из немодельного объекта модельный.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

Bryozoa, department, metazoa, Mollusca, phd, phd3

Доклады аспирантов 10 декабря: обновлено

Продолжаем слушать аспирантов:

10 декабря (вторник), 17:30, аудитория 140 (3058)

(UPD: перенесен на 17.12) Елена Беликова (3 год). Эволюция мышечной системы морских мшанок (Stenolaemata и Gymnolaemata). Научный руководитель А.Н. Островский.

Валерия Хабибулина (4 год). Особенности формирования и развития планулоидов у сцифистом Cassiopeia andromeda. Научный руководитель В.В. Старунов.

Екатерина Кроль (1 год, кафедра прикладной экологии). Моллюски подкласса Vetigastropoda в морях евразийской Арктики и северной Пацифики: интегративная систематика, распространение, структура популяций. Научный руководитель Е.В. Абакумов, научный консультант И.О. Нехаев)

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

Bryozoa, department, metazoa, Mollusca, phd, phd3

Доклады аспирантов 3 декабря: обновлено

В программе — доклады аспирантов 3-го года об их научных успехах.

3 декабря (вторник), 17:30, аудитория 140 (3058)

Владимир Кутюмов. Модульный рост пресноводной мшанки Cristatella mucedo: геномный и транскриптомный анализ. Научный руководитель А.Л. Мальцева.

UPD: доклад Арсения Лобова отменяется, просим прощения за изменения в программе.

UPD: программа дополнена 5-минутным выступлением Елизаветы Гафаровой с анонсом темы магистерской.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

department, msc, msc1

Анонсы новых магистерских тем

В этом году на кафедре 9 студентов первого курса магистратуры. Настало время в экспресс-режиме (5 минут на одно выступление) послушать об их научных планах!

26 ноября (вторник), 17:30, аудитория 140 (3058)

Дарья Вихрева. Научный руководитель А.Л. Мальцева.
Ксения Жуковская. Научный руководитель С.А. Корсун.
Станислав Илюткин. Научный руководитель А.А. Миролюбов.
Надежда Карагодина. Научный руководитель А.Э. Вишняков.
Алиса Прибышина. Научный руководитель Т.Г. Зачепило (Институт физиологии им. Павлова)
Иван Сюткин. Научный руководитель Д.Ю. Крупенко.
Екатерина Фролова. Научный руководитель Е.С. Насонова.
Анна Шапкина. Научный руководитель В.В. Старунов.
*Выступление Елизаветы Гафаровой (научный руководитель А.Л. Мальцева) откладывается

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

department, evolution, metazoa, Mollusca, phd, phd1, sci

Семинар 19 ноября

На ближайшем семинаре — три доклада, разнообразие жанров и тем!

19 ноября (вторник), 17:30, аудитория 140 (3058)

Елена Беликова, Анна Квач, Владимир Кутюмов.
Рассказ о школе «Evolution of coloniality and modularity» в Бразилии.

А. Л. Мальцева, А. И. Гранович.
Параллельное видообразование: тестирование гипотезы.

Антон Ковалёв (аспирант 1-го года; науч. рук. В.М. Хайтов).
Физиологические различия особей криптических видов р. Mytilus.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.