metazoa, protista, sci

О светочувствительных каналах у одноклеточных эукариот

В первый весенний день — приглашённый научный доклад. Будем слушать нашего выпускника, присоединяйтесь!

1 марта(вторник), 17:30, только онлайн*

Андрей Розенберг, Факультет Биологии, Технион — Израильский технологический институт, Хайфа, Израиль

О светочувствительных каналах у одноклеточных эукариот и о том, как гигантские вирусы украли родопсины у своих хозяев

Как и у животных, у многих микробов есть родопсины — мембранные светочувствительные белки с ретиналем в качестве хромофора. Микробные родопсины за свою долгую эволюционную историю дали начало белкам с широким спектром активностей. Самые распространенные в природе родопсины — ионные насосы — используются многими прокариотами для получения энергии путем создания градиента ионов. В отличие от них, микробные родопсиновые рецепторы наделяют своих обладателей способностью к восприятию света, используя при этом механизмы, отличные от неродственных им животных родопсинов. Каналродопсины одноклеточных водорослей делают это путем модуляции мембранного потенциала — открываясь при поглощении фотонов света и деполяризуя или гиперполяризуя клеточную мембрану. Эти свойства делают каналродопсины и другие микробные родопсины удобными инструментами для изучения и контроля индивидуальных клеток многоклеточных организмов in situ, откуда происходит пристальный интерес к этим белкам. Мы же поговорим о функциональной (мета)геномике, распространении каналродопсинов с разными активностями у одноклеточных эукариот и даже гигантских вирусов, их связи со “зрением”, а также о конвергентно возникших на принципиально иной основе родопсиновых каналах, формирующих гигантские мультимерные комплексы — их непростой эволюции и немного об их уникальных биофизических свойствах.

*Для получения ссылки к Zoom заполните, пожалуйста, эту форму Обратите внимание: в этот раз ссылка не такая, как обычно на кафедральном семинаре.

department, metazoa, sci, Tardigrada

Тихоходки: расплетая узлы старой систематики

В продолжение весенней программы — кафедральный научный доклад по совсем свежим материалам!

22 февраля (вторник), 17:30, очно в 140 аудитории и онлайн

Туманов Денис Владимирович, каф. зоологии беспозвоночных СПбГУ

Филогенетические связи базальных групп тихоходок надсемейства Hypsibioidea: расплетая узлы старой систематики

О том, как участвовать в семинаре онлайн, читайте здесь.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для прохода в здание университета нужна маска, а также паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Посещение свободное.

Mollusca, sci

В поисках утраченного жемчуга

15 февраля (вторник), 17:30, очно в 140 аудитории и онлайн

— доклад по материалам докторской диссертации (специальность — зоология)

Попов Игорь Юрьевич, с. н. с. Кафедры прикладной экологии СПбГУ
Переоткрытие южных популяций пресноводных жемчужниц Margaritifera margaritifera России как модель исследования распространения и численности представителей уязвимых видов животных

Обыкновенная жемчужница Margaritifera margaritifera является редким и уязвимым видом, поэтому требует внимания. Вид обычно исследовался на Севере, где имеет относительно высокую численность. Южные популяции длительное время оставались неисследованными, что способствовало вымиранию большей их части. Доклад посвящён обстоятельствам переоткрытия южных популяций и аналогичным работам, выполненным на других объектах в недавнее время.

File:Margaritifera margaritifera (MNHN-IM-2000-22478).jpeg
Margaritifera margaritifera — By Manuel CABALLER, Muséum national d’histoire naturelle, CC BY 4.0, via Wikimedia Commons

О том, как участвовать в семинаре онлайн, читайте здесь.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для прохода в здание университета нужна маска, а также паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Посещение свободное.

metazoa, sci

Эволюция генов на примере ядов пчёл и змей

Следующий семинар пройдёт в сотрудничестве с Биосеминарами (bioseminars.ru). Докладчик выступит онлайн в Zoom. Приглашаем вас вместе послушать трансляцию в 140 аудитории — или присоединиться онлайн. Ссылка в этот раз нестандартная, чтобы получить ее накануне семинара, заполните, пожалуйста, форму: https://forms.gle/7xik6tJsYVEun8UM7

19 октября (вторник), в Zoom,с трансляцией в 140 аудитории

Иван Колударов, PhD

Университет Юстуса Либиха и Мюнхенский Технический Университет, Германия

Эволюция генов на примере ядов пчёл и змей: косные модели и пластичная природа

За последние несколько десятилетий количество геномных данных выросло таким образом, что большую их часть видели только компьютеры. И хотя многие современные исследования используют это богатство непросеянной информации, то, что известно, несоизмеримо меньше того, что можно узнать. Генетика по-прежнему цепляется за примитивные модели эволюции генов, которые не подвергались пересмотру больше полувека. В этом семинаре мы поговорим про эволюцию биологических функций, как лучше всего использовать современные данные для её изучения и что это всё может значить для биологии 21го века.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для прохода в здание университета нужна маска, а также паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Посещение свободное.

department, metazoa, sci, Tardigrada

Тайное становится явным: тихоходки

Рады пригласить вас на открытие нового сезона семинаров! Начинаем с научного доклада.

12 октября (вторник), 17:30, очно в 140 аудитории и онлайн

Туманов Денис Владимирович, каф. зоологии беспозвоночных СПбГУ

Тайное становится явным. Филогенетическое положение антарктического рода Ramajendas (Tardigrada, Eutardigrada) по данным молекулярно-генетического анализа

О том, как участвовать в семинаре онлайн, читайте здесь.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для прохода в здание университета нужна маска, а также паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Посещение свободное.

Bryozoa, department, metazoa, Mollusca, Nematoda, sci

Симбионты мшанок, нематоды, а так же криптические виды литторин

Научный доклад о бактериальных симбионтах мшанок, а также два доклада по мотивам бакалаврских работ:

27 апреля (вторник), 17:30, ОЧНО с трансляцией в Zoom

— (науч.) А.Э. Вишняков. Бактериальные симбионты мшанок: не у всех все дома.
— (бак. 4 к.) Владимир Ганкевич. Филогенетический анализ семейства Mermithidae на основе молекулярных данных. Науч. рук. А.И. Гранович. Науч. конс. В.А. Крапивин; Б.Д. Ефейкин (ИПЭЭ им. А. Н. Северцова РАН)
— (бак. 4 к.) Д.Смутин. Филогеографический анализ группы криптических видов подрода Neritrema Récluz, 1869 (род Littorina) с использованием 2bRAD подхода. Науч. рук. А.Л. Мальцева.

Bugula neritina (фото — А.Н. Островский)

О том, как участвовать в семинаре онлайн, читайте здесь.

Bryozoa, Crustacea, department, metazoa, msc, msc2, sci

Экзаптации мшанок, а так же интерна корнеголовых раков

Научный доклад, а так же доклад магистранта по материалам выпускной работы:

13 апреля (вторник), 17:30, ОЧНО с трансляцией в Zoom

— (науч) А.Н. Островский, У.А. Неклюдова. Всё не как у всех: ценоциты и экзаптации у циклостомных мшанок.

— (маг. 2 к.) Станислав Илюткин. Модульное строение и особенности развития интерны Peltogasterella gracilis. Науч. рук. Д.Ю. Крупенко, науч. конс. А.А. Миролюбов.

О том, как участвовать в семинаре онлайн, читайте здесь.

evolution, sci

Быстрые радиации: опыт исследований полевок и леммингов

На первом весеннем семинаре — приглашённый доклад коллег-зоологов из ЗИНа

3 марта (вторник), 17:30, аудитория 140 (3058)

Лаборатория молекулярной систематики ЗИН РАН

Наталья Иосифовна Абрамсон, к.б.н., зав. лаб.
Ольга Васильевна Бондарева, аспирант
Евгений Александрович Генельт-Яновский, к.б.н, н.с.

Быстрые радиации: распутывание сложных филогенетических клубков и поиск следов отбора в геноме. Пример исследований полевок и леммингов.

Вместе с развитием методов высокопроизводительного секвенирования (next generation sequencing, NGS) у исследователей  появилась возможность коренным образом поменять прежний подход, основанный на данных анализа отдельных, немногочисленных локусов и протестировать многие, противоречивые с точки зрения морфологических данных, молекулярные филогении и эволюционные сценарии. Исследования, основанные на полногеномных и транскриптомных данных, позволяют подойти к анализу молекулярных основ формирования адаптаций на различной эволюционной шкале, сравнивая крупные таксоны и таксоны видового уровня (макротаксономический и микротаксономический уровень). Хорошую возможность выяснить механизмы, способствующие видообразованию и дивергенции, дает исследование групп, которые претерпели быстрые радиации в недавнем прошлом. Однако реконструкция филогенетических связей в таких группах с быстрой радиацией представляет собой труднейшую задачу, практически неразрешимую при применении небольшого количества молекулярных маркеров. В то же время надежная реконструкция филогении — необходимое условие и контекст для любого рода эволюционных исследований. Поскольку процессы быстрой радиации повторяются в разных узлах эволюционного дерева, то у исследователей постоянно возникают и огромные трудности с выявлением филогенетических взаимоотношений в этих узлах, так называемых “жестких политомий”.

С развитием высокопроизводительного секвенирования, когда в анализ включаются одновременно тысячи маркеров, возможность разрешения таких политомий и уточнения филогенетических схем становится выполнимой задачей.

Модельная группа, о которой пойдет речь в наших сообщениях — подсемейство полевочьих (Arvicolinae) — очень хороший объект для исследования перечисленных вопросов по целому ряду причин. Это одна из самых молодых, быстро эволюционирующих и многочисленных групп в подотряде мышеобразных грызунов, распространенных во всех ландшафтах умеренной и арктической зон северного полушария. Она великолепно представлена в палеонтологической летописи, что делает возможным калибровку молекулярных деревьев и расчет времен дивергенций и скорости мутаций. Эта группа представляет собой одну из самых быстрых документированных радиаций среди современных млекопитающих и в течении ее эволюционного развития наблюдается, по крайней мере, еще два-три таких “взрывных” этапа быстрой дивергенции (Абрамсон и др., 2009). До настоящего времени, несмотря на ее интенсивное изучение, в том числе и с применением молекулярных методов, неизвестными остаются филогенетические связи в подсемействе на разных уровнях дивергенции. Полевочьи освоили самые разнообразные экологические ниши, а сходные адаптации, в частности, к жизни под землей или высокогорьях, возникали неоднократно в различных филогенетических линиях.

Во время доклада мы представим предварительные результаты анализа филогении полёвочьих с использованием данных секвенирования полных митохондриальных геномов и поиска следов отбора в белок-кодирующих митохондриальных генах.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

Bryozoa, Cnidaria, department, Digenea, evolution, metazoa, Mollusca, phd, phd2, phd3, sci

Неделя семинаров :Р

На следующей неделе каждый вечер на кафедре в аудитории 140 (3058) будут научные мероприятия. Обратите внимание, что начало в 17:00, кроме вторника (17:30). Если коротко:

  • 16, 18 и 20 декабря в 17:00 — лекции Григория Гениховича (Университет Вены) по эволюционной биологии развития. Совместное мероприятие с Биосеминарами, подробнее о миникурсе можно узнать здесь.
  • 17 декабря в 17:30 — доклады аспирантов на семинаре кафедры
  • 19 декабря в 17:00 — предзащита кандидатской диссертации Арсения Лобова

И чуть подробнее, по дням:

16 декабря (понедельник), 17:00 (~3 часа)
Григорий Генихович. Эволюционная биология развития. Лекция 1. Молекулярные механизмы возникновения различий .

17 декабря (вторник), 17:30
— Елена Беликова (3 год). Эволюция мышечной системы морских мшанок (Stenolaemata и Gymnolaemata). Научный руководитель А.Н. Островский.
— Пётр Смирнов (1 год). «Пассивные» мирацидии. Морфология и метаморфоз миниатюризированных личинок. Научный руководитель К.В. Галактионов.

18 декабря (среда), 17:00 (~3 часа)
Григорий Генихович. Эволюционная биология развития. Лекция 2. Механизмы формирования паттерна.

19 декабря (четверг), 17:00
Арсений Лобов. Анализ белков взаимодействия гамет в системе криптических видов моллюсков рода Littorina. Предзащита кандидатской диссертации. Научный руководитель А.Л. Мальцева.

20 декабря (пятница), 17:00 (~3 часа)
Григорий Генихович. Эволюционная биология развития. Лекция 3. 3.1. Проблема гомологии и аналогии. 3.2. Как сделать из немодельного объекта модельный.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.

department, evolution, metazoa, Mollusca, phd, phd1, sci

Семинар 19 ноября

На ближайшем семинаре — три доклада, разнообразие жанров и тем!

19 ноября (вторник), 17:30, аудитория 140 (3058)

Елена Беликова, Анна Квач, Владимир Кутюмов.
Рассказ о школе «Evolution of coloniality and modularity» в Бразилии.

А. Л. Мальцева, А. И. Гранович.
Параллельное видообразование: тестирование гипотезы.

Антон Ковалёв (аспирант 1-го года; науч. рук. В.М. Хайтов).
Физиологические различия особей криптических видов р. Mytilus.

Семинары проходят в Главном здании СПбГУ: от входа на Менделеевской линии надо подняться на второй этаж, пройти по коридору направо до следующей лестницы и там — на третий. Аудитория будет слева. Для проходя в здание университета нужен паспорт или другой документ; охраннику можно сказать, что Вы идёте на кафедру зоологии беспозвоночных. Перед началом семинара и в перерывах мы угощаем всех чаем и сладостями. Посещение свободное, видеозаписи и трансляций мы не ведем.